Přeplatek musí být daňovému subjektu poukázán do 30 dnů od doručení žádosti, pokud zvláštní zákon nestanoví jinak.
Za den poukázání přeplatku se považuje den, kdy došlo k jeho odepsání z účtu správce daně.
Nemá-li daňový subjekt ke dni podání žádosti u správce daně vratitelný přeplatek, běží lhůta pro jeho vrácení až ode dne následujícího po jeho vzniku (po dosažení částky 100 Kč), pokud se tak stane nejdéle do 60 dnů ode dne podání žádosti.
Nevznikne-li do této lhůty vratitelný přeplatek, žádost se zamítne.
Nepožádá-li daňový subjekt o vrácení vratitelného přeplatku do 6 let od konce roku, ve kterém přeplatek vznikl, přeplatek zaniká.
Vznikne-li v důsledku zrušení, změny nebo prohlášení nicotnosti rozhodnutí o stanovení daně, jakož i v důsledku neoprávněného vymáhání, vratitelný přeplatek, vrátí jej správce daně bez žádosti (tj. z moci úřední) do 15 dnů ode dne účinnosti rozhodnutí, kterým bylo rozhodnutí o stanovení daně zrušeno, změněno nebo prohlášeno za nicotné, anebo ode dne prohlášení neoprávněného vymáhání.
